唐氏综合征患儿外周血全基因组miRNA差异表达及生物学功能分析
李武县1
陈红2
罗婷婷1
李秋红1
徐勇3
戴勇3
1.重庆市妇幼保健院检验科 重庆4000132.重庆市第七人民医院检验科 重庆4000543.深圳市人民医院临床医学研究中心 广东深圳518020
摘要：目的 检测唐氏综合征(DS)患儿与健康儿童外周血单个核细胞miRNA表达的差异,探索DS患儿21号3染色体扰乱2倍体基因表达和免疫缺陷的形成机制.方法 收集6例标准核型DS患儿(DS组)和6例健康儿童(non-DS组)外周血标本,分别提取各组样本外周血单个核细胞总RNA等量混合,构建DS组和non-DS组small RNA文库,采用Illumina测序技术对两组样本外周血单个核细胞miRNA的表达水平进行差异分析,同时对差异表达miRNA调控靶基因进行生物信息学功能分析,并用Stem-loop qRT-PCR对Illumina测序结果 和差异表达miRNA的调控靶基因进行验证.结果两样本总共表达miRNA有911种,其中只有114种miRNA显著性差异表达(差异倍数>2,P<0.001),其中有11种在DS组中低表达,103种高表达,包括编码于21号染色体的5个miRNA(miR-99a、let-7c、miR-125b、miR-155、miR-802).生物学功能分析显示高丰度差异表达miRNA调控靶基因与造血和淋巴器官的发育、胸腺的发育、T/B细胞的分化和活化有关.结论 DS患儿21号3染色体对2倍体miRNA表达丰度的影响较小,21号染色体编码miRNA也未均呈现1.5倍以上的升高,高丰度差异表达的miRNA可能与DS患儿免疫系统的发育缺陷以及DS患儿循环T、B淋巴数量的异常有关.
关键词：微小RNA唐氏综合征外周血单核细胞Illumina深度测序功能分析
资助基金：广东省科技计划(2012B032000008)深圳市科技创新计划(CXZZ20130321090846345)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 2950-2957 )
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