在树突状细胞中筛选与呼吸道合胞病毒诱发哮喘相关的长链非编码RNAs
孙淑宁
乔建瓯
韩肇庆
1.上海交通大学医学院附属第九人民医院呼吸内科 上海2000012.上海交通大学医学院附属第九人民医院呼吸内科 上海2000013.上海交通大学医学院附属第九人民医院呼吸内科 上海200001
摘要：目的 使用人类全转录组芯片检测呼吸道合胞病毒(RSV)诱发哮喘中的树突状细胞(DCs),以筛选差异表达的长链非编码RNAs(lncRNAs).在lncRNAs转录调控层面研究RSV诱发哮喘的机制.方法 设立HDC-BEAS+RSV组?HDC-RSV组和HDC-CONTROL组3组,其中HDC-BEAS+RSV组是将RSV感染的人支气管上皮细胞BEAS-2B和未成熟DCs通过Transwell共培养,HDC-RSV组是将RSV感染未成熟DCs,HDC-CONTROL组是将RSV对照液感染未成熟DCs.使用affymatrix的HTA2.0芯片检测3组DCs中基因和lncRNAs的表达差异,并对其进行聚类分析?GO分析和Pathway分析.结果 筛选出有差异表达的25个基因和29个ln-cRNAs,其中20个基因表达上调,5个基因表达下调,27个lncRNAs表达上调,2个lncRNAs表达下调.上调的基因主要涉及促炎免疫反应,例如信号转导?趋化因子信号传导途径?细胞因子受体相互作用等.结论 我们筛选出了RSV诱发哮喘中差异表达的lncRNAs,为进一步在lncRNA转录调控层面研究RSV诱发哮喘的机制奠定基础.
关键词：呼吸道合胞病毒哮喘树突状细胞长链非编码RNA
资助基金：国家自然科学基金(81170028)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 3229-3234 )
英文信息