中国HCV 2a的分子流行病学研究
王敏1
许茹1
戎霞1
廖峭1
黄杰庭1
宋丹丹2
单振刚1
范小苗1
尤庆柱2
黄珂1
付涌水1
1.广州血液中心、广州市医学重点实验室(血液安全重点实验室)临床输血研究所,广东广州,5100952.南方医科大学检验与生物技术学院,广东广州,510515
摘要：目的 对我国HCV 2a亚型的分子流行病学进行研究.方法 收集全国18个省、直辖市HCV感染患者标本776份,逆转录巢式PCR扩增E1基因,通过比对得出HCV基因分型.从NCBI数据库中下载HCV 2a序列作参考序列,与此次的HCV 2a序列进行分析.在 Exponential模型下进行进化树构建以及BSP曲线绘制.结果 扩增E1基因664份,有8种亚型及HCV 6新亚型:1a、1b、1c、2a、3a、3b、6a、6n、6new的例数分别为10、392、3、127、28、48、44、6、6份.进化树分析显示HCV 2a于20世纪60年代早期分成了两簇,cluster Ⅰ全是来自中国的序列,主要是来自西北的序列,cluster Ⅱ包括了来自全球的序列,clusterⅤ、Ⅵ和Ⅶ显示日本与中国形成各自的传播网络,而cluster Ⅷ和Ⅸ均可以看出是由日本传到中国. BSP曲线显示1992—1996年增长速率明显较快.结论 全国范围内,HCV 1b为最主要亚型,2a次之,HCV 2a尤其在我国北方、东北、西北等省、直辖市分布比较高,还是应该引起足够的重视.进化分析显示HCV 2a一部分序列是由日本传到中国.
关键词：HCV基因分型HCV 2a进化分析
资助基金：国家自然科学基金(81402733)广东省自然科学基金重点项目(2014A030311005)广东省科技计划(2016A020216001)广东省医学科研基金(A2016310)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1789-1794 )
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