胃癌患者伊立替康耐药前后基因表达谱的差异
赵素芳1
李冬兵2
孙大勇1
1.深圳市第二人民医院消化科,广东深圳5180352.广州迈景基因医学科技有限公司,广东广州510300
摘要：目的 旨在通过转录组测序,明确胃癌患者产生伊立替康耐药前后的基因表达谱差异.方法 取胃癌患者用药前后的穿刺组织,进行RNA-seq,测序的覆盖度100×;对测序得到的原始数据通过生物信息学软件进行一些分析.结果 生物信息学分析发现,胃癌患者耐药前后的组织转录水平分别有22003和21127个表达基因,其中有541个差异基因达到显著性水平;GO和KEGG分析发现这些差异基因主要富集在26条生物通路;这些通路与PI3K-Akt信号通路、胃酸分泌、黏附连接、蛋白质的消化和吸收、细胞周期和胆汁分泌相关;最终筛选得到的与胃癌产生伊立替康耐药密切相关的基因包括ABCA3、ADAMTS15、ALMS1、BCL2L11、C1QTNF6、CAPN9、COL12A1、COL5A3、COL7A1、IRF4、KRAS、MPP6、PCDHA1、PIK3CA、POU2AF1和USP13等.结论 本研究提供了胃癌患者耐药前后的转录本信息,获得了与胃癌患者产生伊立替康耐药密切相关的潜在候选基因,为胃癌的个性化精准治疗提供一定的理论基础.
关键词：胃癌转录组测序耐药差异表达基因
分类号：R735.2(消化系肿瘤)R696.3(泌尿科学（泌尿生殖系疾病）)
资助基金：未来产业专项(CXZZ20140829154909599)
论文发表日期：2019-09-10
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 2465-2473 )
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