基于单细胞测序和芯片数据分析强直性脊柱炎合并克罗恩病的肠黏膜免疫浸润和炎症微环境
罗锡庆
古洁若
中山大学附属第三医院风湿免疫科、广东省免疫疾病临床医学研究中心(广东广州 510630)
摘要：目的 解析强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)患者合并克罗恩病(Crohn's disease,CD)的肠黏膜及外周血炎症微环境中免疫细胞浸润特征、炎症相关信号通路的活化情况.方法 对基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中包含CD的AS患者肠黏膜芯片数据进行CIBERSORT反卷积免疫细胞浸润及基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA),探索炎症免疫细胞浸润及通路活化情况,同时对AS合并CD的肠黏膜及外周血的单细胞测序数据集进行细胞亚群T细胞亚群比例比较以及进行炎症相关信号通路的活化情况验证.结果 利用CIBERSORT算法计算芯片样本中不同免疫细胞亚型的百分比,发现AS肠道黏膜组织中CD8+T淋巴细胞的含量随着疾病的发展而增加,从无肠炎到亚临床肠炎再到肠炎时,CD8+T淋巴细胞的含量逐渐增加.对肠黏膜及外周血的淋巴细胞进行单细胞亚群提取并进行炎症相关通路基因集活性打分,发现CD8+T淋巴细胞在肠黏膜中TNFA-SIGNALING-VIA-NFKB、INTERFER-ON-GAMMA-RESPONSE、INFLAMMATORY-RESPONSE在AS合并CD分组中较AS组的通路活性明显升高,但IL17-SIGNALING-PATHWAY无明显激活;而在外周血中,CD8+T淋巴细胞的TNFA-SIGNALING-VIA-NFKB、INTERFERON-GAMMA-RESPONSE、INFLAMMATORY-RESPONSE、IL17-SIGNALING-PATHWAY的通路活性则表现为AS合并CD组比AS组明显升高.单细胞测序中CD8+T细胞在AS合并CD患者外周血中比例增高.结论 AS合并CD患者肠黏膜中TNF-α、IFN-γ相关的炎症信号通路明显激活,外周血CD8+T淋巴细胞比例增高,可作为判断AS合并肠炎的参考指标.
关键词：强直性脊柱炎单细胞测序炎症微环境
分类号：R593.23(全身性疾病)R364.5(病理学)
资助基金：广东省重点领域研发计划项目(2023B1111030002)广东省免疫疾病临床医学研究中心(2020B1111170008)
论文发表日期：2024-01-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：13( 50-62 )
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