基于miRNA-mRNA调控网络分析并验证易损斑块形成的潜在分子机制
张晓璐1
葛为勇2
曾文赟3
于群4
王一婧5
姜希娟1
1.天津中医药大学中西医结合学院(天津 301617)2.滨海慢性病防控与健康创新研究院(天津 300461)3.赣州市人民医院肿瘤科(江西赣州 341000)4.遵义医科大学基础医学院(贵州遵义 563000)5.天津中医药大学护理学院(天津 301617)
摘要：目的 分析并验证易损动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)斑块形成的潜在分子机制.方法 通过形态学染色验证主动脉根和头臂干中是否存在AS斑块.采用GSE34646和GSE34647数据集中的差异表达 miRNA(differentially expressed miRNAs,DEMs)分析并预测 DEMs 靶基因(DEMs-target genes,DEMs-TGs).其次,筛选GSE10000数据集易损斑块中差异表达基因(differentially expressed genes in advanced plaque,DEGs-AP).然后将DEGs-AP与DEMs-TG进行交集,以筛选候选基因.对获得的基因构建PPI网络,并鉴定关键基因.接着建立miRNA-mRNA调控网络,并使用受试者工作特征(ROS)曲线评估关键基因的预后.最后采用RT-qPCR检测主动脉中预测的mRNA和miRNA水平.结果 组织病理学检查显示,模型组有明显的易损斑块.通过GSE34646和GSE34647数据集筛选,在易损斑块中获得44个DEM,并预测得到3 171个和8 075个miRNA靶基因.在GSE10000数据集中,获得了 3 441个DEGs-AP.然后将DEGs-AP和DEMs-TG交集,得到936个候选基因.PPI网络鉴定了 10个上调和10个下调的枢纽基因,用于构建miRNA-mRNA 调控网络.结论 Let-7g-3p-ADAM10/PIK3R1/C3AR1 可能是 RT-qPCR 预测和诊断晚期斑块的潜在miRNA-mRNA调控轴.
关键词：动脉粥样硬化miRNA易损斑块生物信息学
分类号：R541.4(心脏、血管（循环系）疾病)R543.1(心脏、血管（循环系）疾病)
资助基金：国家自然科学基金(82074211)天津中医药大学中西医结合学院研究生创新基金(ZXYCXLX201902)
论文发表日期：2024-07-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 824-831 )
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