基于CMap数据库分析婴幼儿特应性皮炎相关基因及潜在治疗药物
李庆贤
种树彬
曾冰冰
华南理工大学附属第六医院皮肤科(广东佛山 528200)
摘要：目的 该研究采用生物信息分析学结合关联性图谱(CMap),筛选出参与婴幼儿特应性皮炎(AD)致病核心基因和潜在候选药物.方法 基于GSE107361数据库,筛选出AD患者(n=19)与健康人皮肤样品(n=18)的差异表达基因(DEGs),利用多种生物信息分析手段,筛选出AD致病核心基因,并对其进行功能分析.再利用CMap数据库筛选具有AD治疗的潜在候选药物.结果 采用DESeq2规则,对两组数据进行基因差异表达(DEG)分析(log2FC绝对值≥1.0且P＜0.05),鉴定出1 100个上调DEG和1 808个下调DEG.此后,对DEG进行功能富集分析,以log10P＜-1.30为富集标准发现:上调DEG显著富集于角质细胞增殖、细胞周期调控及白细胞介素(IL)-4/IL-17/肿瘤坏死因子-α(TNF-α)炎症通路;下调DEG则与细胞外基质组成和皮肤屏障连接通路显著相关.为了寻找DEG相应蛋白质的相互作用关系,采用STRING网络(置信度≥0.9)进行分析,鉴定出13个关键模块,其中上调关键模块枢纽是PI3k/JAK通路、趋化因子介导获得性免疫反应通路和FGFR2-PDGF-VEGF通路;下调关键枢纽枢纽为细胞外基质构成信号通路.最后将DEG富集数据导CMap数据库,以富集得分≥-90％为标准,筛选出前10个治疗婴幼儿AD的候选药物,硫鸟嘌呤核苷酸(-97.88％)、曲古菌素A(-94.86％)、褪黑素(-95.64％)及血根碱(-93.69％)等,主要靶向细胞周期阻滞、IL-4/IL-17抑制及自噬激活.结论 该研究发现了婴幼儿AD以IL-4/IL-17/TNF-α炎症激活与ECM屏障缺陷为核心基因表达特征,并筛选出硫鸟嘌呤核苷酸等10种具有逆转AD基因表达谱潜力的药物,为后续临床前验证提供精准靶点与理论依据.
关键词：特应性皮炎婴幼儿关联性图谱药物筛选
分类号：R758.2(皮肤病学与性病学)R969(药理学)
资助基金：佛山市自筹经费类科技创新项目(2320001007027)
论文发表日期：2025-07-15
在线出版日期：2025-08-25（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 1028-1035 )
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