整合多个基因表达谱数据识别骨肉瘤发生和进展相关的关键基因
韩小玲
王胜纯
韩俏英
梁兰
广东医科大学,广东东莞 523808
摘要：目的 了解骨肉瘤发生和进展相关的关键基因.方法 将GEO数据库中多个骨肉瘤基因表达谱整合为一个表达矩阵,对骨肉瘤关键基因进行功能注释和通路富集分析,识别模块内与骨肉瘤发生与发展密切相关的关键基因.结果 4个骨肉瘤数据集整合成含有98个样本、13 914个基因表达谱的矩阵文件,识别出骨肉瘤相关程度最高的turquoise模块(cor=0.71,P=4e-16),包括LDHB、CBX2、CCT3、KPNA2、PPAT、MSH6、UBE2C、SNRPA1、CCDC58、TMEM97和KIF2C等11个骨肉瘤关键基因,其中SNRPA1、CCDC58、TMEM97、KIF2C和UBE2C未见报道.结论 发现11个关键基因与骨肉瘤发生和进展相关.
关键词：骨肉瘤GEO数据库关键基因
分类号：R730.231(一般性问题)
资助基金：国家自然科学基金(81702953)广东省医学科研基金项目(A2023169)
论文发表日期：2023-12-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 613-618 )
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