不同病原微生物核酸提取方法的对比
陈涛1
柴海云1
刘彦2
黄月眉1
黄伟1
张召2
林东子3
1.广州南芯医学检验实验有限公司,广东广州 5105352.广东省人体微生态工程技术研究中心,广东广州 5105353.佛山市南海区第四人民医院检验科,广东佛山 528211
摘要：目的 通过肺泡灌洗液模拟样本,比较不同提取试剂对病原微生物DNA的提取效果.方法 选择白念珠菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、大肠埃希菌等代表菌,根据肺泡灌洗液细胞含量,添加特定数量的细胞及不同浓度的混合菌液,模拟临床肺泡样本.采用3种市售核酸提取试剂盒(凯杰、诺唯赞、美基)与自研优化后(南芯自研)的方法进行核酸提取,通过对核酸提取质量及PCR扩增结果对比提取效率.结果 南芯自研试剂与3个品牌各样本的A260/A280比较差异均无统计学意义(P＞0.05).当菌液浓度≥105 CFU/mL时凯杰提取核酸浓度最高,南芯自研次之(P＜0.01).4个不同样本中,3家品牌试剂处理的4种微生物的Ct值与南芯自研提取试剂比较,差异有统计学意义(P＜0.01或0.05).当菌液浓度≥104 CFU/mL时,南芯自建提取试剂对应的Ct均低于另外3种提取试剂(P＜0.01或0.05).结论 南芯自研核酸提取方法是一种性价比较高的病原微生物核酸提取法.
关键词：病原微生物核酸提取实时荧光定量PCR
分类号：R511(传染病)
资助基金：国家自然科学基金(82003786)广东省科技厅基础与应用基础研究基金(2019A1515110338)佛山市科技创新团队(青年拔尖人才)(2120001010795)(2120001010795)
论文发表日期：2023-12-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 619-622,627 )
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