组织培养条件下苹果Ty1-copia类逆转座子的转录活性
孙俊1
房经贵2
陶建敏2
蔡斌华2
章镇2
1.南京农业大学园艺学院,南京,210095;安徽农业大学园艺系,合肥,2300362.南京农业大学园艺学院,南京,210095
摘要：研究了苹果基因组中Ty1-copia类逆转座子的转录活性、多样性及其甲基化水平.在培养基MS+2,4-D 2mg/L+BA 0.2 mg/L+NAA 0.5 mg/L上诱导了1个月的愈伤组织中用RT-PCR方法检测到了270 bp的目的条带,而对照、继代组培苗和不含2,4-D的愈伤中均没有目的条带的扩增,说明一定浓度的2,4-D可以诱导苹果中Ty1-copia类逆转座子的表达活性.将目的条带回收、克隆和测序后进行分析:所克隆的21条序列虽都为Ty1-copia类逆转座子逆转录酶保守序列,但存在很大的异质性,21个克隆的核甘酸序列变化范围为196-290 bp;翻译成氨基酸后存在缺失、插入、移框和终止密码子突变,7个克隆在氨基酸保守序列‘SLYGLKQ'处有1-2氨基酸位点的突变,说明这些序列对应的逆转录酶多数可能已失去了其原有功能.将21条序列进行聚类分析,除ART20外,其它克隆可聚为3类,并分别与GenBank上某些物种的相应序列同源性很高,表明在不同物种间可能存在逆转座子的横向传递作用.甲基化试验表明苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子甲基化水平高.这些都表明Ty1-copia类逆转座子对苹果基因型的多样性及基因组的进化具有重要意义.
关键词：苹果Ty1-copia类逆转座子转录活性组织培养
分类号：S661.1(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(30200190)
论文发表日期：2005-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 441-445 )
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