砂梨扩展蛋白基因cDNA克隆及全序列分析
宋长年1
乔玉山1
章镇1
胡钟东1
渠慎春1
熊爱生2
姚泉洪2
1.南京农业大学园艺学院果树生物技术研究室,南京,2100952.上海市农业科学院生物技术研究所,上海,201106
摘要：设计植物EXP扩展蛋白简并引物,以砂梨果实cDNA为模板.克隆得到EXP基因cDNA片段.该片段长465 bp.根据该片段序列,分别设计2条5'和3'末端扩增的特异引物,利用RACE技术,获得了该片段的5'端和3'端序列.用DNAMAN5.22软件对3个序列进行拼接和分析,获得了该基因的cDNA全长,命名为Pyp-EXP.该cDNA全长为1 395 bp,5'端起始密码子ATG始于72 bp,3'端终止子TAG止于830 bp,Ploy+(A)从1 363～1 395 bp.该基因已在GenBank基因数据库注册,注册号为EF602031.Pyp-EXP核苷酸序列有一个759 bp完整的开放阅读框,编码区与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃的同源性分别为96%,96%,94%和86%;该cDNA推导编码252个氨基酸,含有1个组氨酸(His_Phe_Asp,HFD)功能域,与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃中相应序列同源性分别为98%,97%,95%和93%.该基因的克隆为研究扩展蛋白的时空表达及其在果实发育和成熟过程中的作用奠定了基础.
关键词：砂梨扩展蛋白分子克隆序列分析
分类号：S665.1(果树园艺)
资助基金：国家高技术研究发展计划（863计划）(BG2006313)国家高技术研究发展计划（863计划）(2006AA100108)
论文发表日期：2008-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 166-171 )
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