槜李等15个李品种S基因型鉴定及其多态性分析
张树军1
黄绍西1
张绍铃1
吴俊1
衡伟1
吴华清1
宋宏峰2
1.南京农业大学园艺学院,南京,2100952.江苏省农业科学院园艺研究所,南京,210014
摘要：利用李属S-RNase基因特异性引物,对15个供试李品种进行PCR扩增,共获得30个目的条带.对这些目的条带进行测序鉴定出15个李品种的S基因型.通过与NCBI中利用BLASTn与GenBank+EMBL+DDBJ+PDB等数据库中的序列比对,结果表明,其中9个为新S-RNases基因,对9个新S-RNases核苷酸序列进行分析发现,位于高变区内的内含子大小为141～1758bp,其同源性为33.9%(S-18～S-19)～81.6%(S-20～S-21),表现出丰富的长度和序列多态性;编码区的核苷酸序列比对结果,其同源性为73.3%(S-16～S-19)～91.7%(S-17～S-22);其推导氨基酸序列相似性为67.3%(S-16～S-19)～89.1%(S-17～S-22);包含李属S-RNase一级结构所共有的C2、C3保守区和高变区(RHV).系统进化分析表明,9个新S-RNases与李属其它树种S-RNases聚类在一起,归属为李亚科(Prunoideae).
关键词：李自交不亲和性S-Nase基因
分类号：S662.3(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(30671437)
论文发表日期：2008-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 338-342 )
英文信息