基于EST数据库的葡萄APETALA2基因cDNA克隆及其表达分析
王晨
刘洪
房经贵
宋长年
曹雪
杨光
章镇
1.南京农业大学园艺学院,南京,2100952.南京农业大学园艺学院,南京,2100953.南京农业大学园艺学院,南京,2100954.南京农业大学园艺学院,南京,2100955.南京农业大学园艺学院,南京,2100956.南京农业大学园艺学院,南京,2100957.南京农业大学园艺学院,南京,210095
摘要:APETALA2(AP2)是拟南芥生长发育特别是花器官发育过程中重要的调控基因.利用生物信息学方法以拟南芥APETALA2基因 cDNA序列作为模板,对葡萄EST数据库进行同源检索筛选,电子克隆出葡萄AP2基因(Vv-AP2)cDNA序列.以香悦葡萄花cDNA为模板,根据电子克隆的葡萄AP2基因cDNA序列设计特异引物,分别利用RACE技术和特异PCR技术获得该基因3'末端和5'末端,序列拼接后获得葡萄的APETALA2基因的cDNA全长.该cDNA的全长为2 208 bp,命名为Vv-AP2.Vv-AP2核苷酸序列有一个1 536 bp完整的开放读码框(ORF),其5'与3'末端非翻译区分别为268 bp和376 bp.其中,3'末端含有28 bp的Ploy~+(A).该基因在GenBank基因数据库的注册号为FJ809943.氨基酸推导结果表明该cDNA共编码了511个氨基酸,具备完全保守的核定位信号序列(KKSR)以及2个高度保守的重复序列即AP2结构域.分别采用半定量RT-PCR和SYBR Green I实时定量RT-PCR初步分析了Vv-AP2在葡萄叶、茎、花序、花等不同器官中的表达水平.其中,Vv-AP2在花序和花中的表达量明显高于叶和茎.
关键词:葡萄Vv-AP2基因克隆表达分析
分类号:S663.1(果树园艺)
资助基金:教育部人文社会科学规划项目(20080440161)
论文发表日期:2010-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 207-212 )
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