杧果MGAPDH同源基因的克隆及其表达分析
罗聪1
何新华2
胡颖1
谭超1
欧世金1
1.广西大学农学院,南宁,5300042.广西大学农学院,南宁530004/广两作物遗传改良与生物技术重点实验室,南宁530007
摘要:甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)是糖代谢和能量代谢过程中的关键酶。根据GAPDH基因保守序列设计PCR引物,利用RT-PCR和改良RACE技术,首次从杧果中分离克隆出MGAPDH同源基因的cDNA全长序列。该序列全长为1 356 bp,开放阅读框为1 203 bp,编码401个氨基酸。利用分子生物学软件对MGAPDH蛋白进行生物信息学分析,结果显示:MGAPDH蛋白分子量为42.8 ku,等电点为8.9;该蛋白包含2个功能域,即NADB_Rossmannsuperfamily和Gp_dh_C superfamily;MGAPDH蛋白不含信号肽序列和跨膜结构,是非分泌蛋白,位于叶绿体中。氨基酸序列进化分析结果显示,杧果MGAPDH蛋白可能与光合作用有关。半定量分析显示,杧果MGAPDH同源基因在杧果不同组织中均表达,并且表达水平差异不明显,说明杧果MGAPDH同源基因可作为杧果基因差异表达的内参基因。
关键词:杧亡、果甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)表达分析序列分析
分类号:S667.7(果树园艺)
资助基金:广西壮族自治区高等学校项目(201065)广西自然科学基金(2011GXNSFA018115)广西教育厅研究生创新计划(105931001011)
论文发表日期:2011-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
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果树学报

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北大核心CSTPCD
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2011,28(6)
所属栏目:研究论文