桃2个endo-PG基因序列SNPs的遗传多样性及其与果实黏离核性状的关联分析
麻国升
王力荣
曹珂
朱更瑞
方伟超
陈昌文
王新卫
1.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500092.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500093.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500094.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500095.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500096.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500097.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州450009
摘要：[目的]解析桃果实黏离核性状的分子机制.[方法]以不同黏离核性状的45份桃野生资源、地方品种和育成品种为试材,采用第2代测序技术鉴定2个通过连锁分析得到的、串联重复的endo-PG基因在45份种质中的SNPs(single nucleotide polymorphisms)信息;继而采用GLM (Generalized Linear Models)和MLM (Mixed Linear Models)模型进行关联分析,鉴定与黏离核性状关联的SNPs.[结果]在ppa006839m和ppa006857m这2个endo-PG基因内共鉴定到98个SNPs,平均1 SNPs/59 bp.在少数位点上,离核和黏核种质的SNPs多态性存在差异,但整体多样性水平差异不显著,暗示这2个endo-PG基因倾向于中性进化.根据98个SNPs位点信息构建的系统发育树能够反映这些种质的进化关系,即光核桃、甘肃桃最为原始,山桃其次,普通桃最为进化.GLM关联分析结果表明,在ppa006839m基因的内含子3区存在一个与黏离核性状显著关联的位点,对表型变异的解释率为21.1％,但经Bonferroni多重检验校正后,该位点并无统计学意义.而MLM模型的关联分析并没有检测到显著关联位点.[结论]研究结果虽然没能解释果实黏离核的分子机制,但暗示ppa006839m可能与该性状存在更为紧密的联系.同时,研究结果也为果实黏离核性状的分子标记辅助育种奠定基础.
关键词：桃遗传多态性endo-PG基因黏离核关联分析
分类号：S662.1(果树园艺)
论文发表日期：2014-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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