‘库尔勒香梨’脱萼组与宿萼组样品差异表达基因的筛选
孙晓霞
牛建新
王博慧
裴茂松
李陈静
曹福军
1.石河子大学农学院园艺系,新疆石河子832003;特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320032.石河子大学农学院园艺系,新疆石河子832003;特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320033.石河子大学农学院园艺系,新疆石河子832003;特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320034.石河子大学农学院园艺系,新疆石河子832003;特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320035.石河子大学农学院园艺系,新疆石河子832003;特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320036.石河子大学农学院园艺系,新疆石河子832003;特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子832003
摘要：[目的]系统研究‘库尔勒香梨’脱萼组和宿萼组花器官的转录组表达情况,筛选2者之间的差异表达基因,为进一步阐明‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存分子机理奠定基础.[方法]采用Illumina高通量测序技术对‘库尔勒香梨’脱萼组和宿萼组代表样品进行测序,利用生物信息学方法筛选2者的差异表达基因和进行功能基因预测.[结果]Trinity法拼接后得到48 894条unigenes序列,从中选取了2组样品中共表达和单独表达的SPL转录因子进行了功能探究,发现3条unigenes可能与萼片发育有关.筛选的差异表达基因获得了Gene Ontology和KEGG数据库的注释,涉及植物激素信号转导、光合代谢、苯丙氨酸代谢、芳香族化合物合成、细胞发育等与萼片发育相关过程.[结论]筛出了2组样品的差异表达基因,获得了与萼片发育相关的基因及其对应的功能注释,为今后进一步研究‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存分子机理奠定了良好基础.
关键词：’库尔勒香梨’萼片转录组测序差异表达分析基因功能注释
分类号：S661.2(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(30360066)国家科技攻关计划(2003BA546C)兵团科技攻关计划(2011BA003-3)兵团科技创新团队建设项目(2013CC002)
论文发表日期：2015-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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