2个中亚杏S-RNase基因全长的克隆与序列分析
李亚兰
刘小芳
刘海楠
李文慧
冯建荣
1.石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320032.石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320033.石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320034.石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320035.石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子832003
摘要：[目的]克隆中亚杏(Prunus armeniaca)品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列,为分子手段调控杏自交不亲和性状奠定基础.[方法]以新疆栽培杏品种‘索格佳娜丽’和‘赛买提’为试材,利用RT-PCR克隆2个品种的花柱S-RNase基因cDNA片段,RACE技术进行cDNA全长克隆,采用BLAST进行序列比对,Protparam软件分析2个基因的编码蛋白特性,MEGA 5.0构建进化树.[结果]从‘索格佳娜丽’中克隆了S5:RNase(KF951503)基因,从‘赛买提’中克隆了一个新的S53--RNase (KF975455)基因DNA和cDNA全长序列.&2-RNase的DNA全长2 200 bp,cDNA全长765 bp,ORF(开放阅读框)长681 bp,编码226个氨基酸;S5:RNase的DNA全长1 664 bp,cDNA全长907 bp,ORF长732 bp,编码242个氨基酸.BLASTP比对显示:这2个基因都具有保守的RNase-T2基因结构,属于RNase-T2家族.预测相对分子质量分别为26.5 ku和27.5 ku,等电点为9.36和9.03,都属于亲水性蛋白.进化分析表明,S.与李(Prunus salicina,S7)、S.与大岛樱(Prunus speciosa,S13)亲缘关系最近,S13和S13处在2个不同的分支上,表现出较高的序列多态性,表明2个基因亲缘关系较远.[结论]获得了2个中亚杏品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列.
关键词：杏自交不亲和S-RNase基因RACE
分类号：S662.2(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31272129)
论文发表日期：2015-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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