葡萄实时定量PCR中稳定内参基因的筛选
查倩1
奚晓军2
蒋爱丽2
田益华2
王世平3
1.上海农业科学院林木果树研究所,上海201403;上海交通大学农学与生物技术学院,上海2002402.上海农业科学院林木果树研究所,上海,2014033.上海交通大学农学与生物技术学院,上海,200240
摘要：[目的]通过geNorm软件筛选实时荧光定量PCR稳定内参基因,基于多内参基因评价体系进行目的基因相对表达量的计算.[方法]获得不同葡萄品种叶片和果皮中6个候选内参基因的循环阈值(Ct),利用geNorm软件计算内参基因平均表达稳定性数值M和基因配对差异值V,从而判断内参基因最适组合.[结果]发现候选内参基因表达稳定性由高到低的排列顺序为VvEF1 r =VvEF1-α＞VvGAPDH ＞VvACTIN＞ VvACT1＞VvUBQ,不同组织分别分析均发现VvEF1α和VvEF1r的稳定性最高,且基因配对差异值V2/3为0.104,所以内参基因的最适组合为VvEF1α和VvEF1r.利用geNorm软件计算得到的多内参基因评价体系的标准化因子可应用于目的基因的相对表达量分析.[结论]geNorm软件筛选实时荧光定量PCR稳定内参基因的方法可以应用到多条件和多组织的不同植物样本中,并用于目的基因表达谱的研究,具有重要的广泛应用价值.
关键词：葡萄geNorm内参基因标准化因子实时荧光定量PCR
分类号：S663.1(果树园艺)
资助基金：国家葡萄产业技术体系项目(CARS-30-9)上海市农委科技兴农推广项目(2012)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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