柑橘TCP家族生物信息学及表达谱分析
周延培
张雅剑
伊华林
1.华中农业大学园艺林学学院·园艺植物生物学教育部重点实验室,武汉4300702.华中农业大学园艺林学学院·园艺植物生物学教育部重点实验室,武汉4300703.华中农业大学园艺林学学院·园艺植物生物学教育部重点实验室,武汉430070
摘要：[目的]分析柑橘TCP蛋白家族成员的序列特征和系统进化关系,探究TCP家族成员在柑橘果实发育中的功能.[方法]通过生物信息学方法分析柑橘基因组中TCP家族成员的结构、染色体位置和系统进化关系.以‘兴锦101’(WT)及其晚熟芽变(MT)为试材,利用TA方法克隆柑橘TCP家族2个成员CsTCP1和CsTCP3,通过qRT-PCR测定TCP家族成员在‘兴锦101’及其晚熟芽变果实不同发育时期的相对表达量.[结果]克隆的2个基因CsTCP1和CsTCP3与原序列比对结果相似性达到100％;柑橘全基因组共编码20个TCP转录因子成员,分布在7条染色体上,都含有非典型的BHLH结构域,系统进化关系结果将Cs TCPs分为2个亚家族:Class Ⅰ和Class Ⅱ;多数基因结构简单,没有内含子;同时,定量结果表明CsTCP基因在不同组织中的相对表达量存在差异,且被聚为2类;此外,在‘兴锦101’及其晚熟芽变果实不同发育时期中同样差异表达,多数基因相对表达量在花后215d达到峰值,且在该时期2者间差异较显著.[结论]获得20个柑橘TCP家族成员基因,表达量分析显示TCP家族成员基因可能在柑橘的生长发育过程中起到重要的作用,为今后柑橘育种工作奠定了一定的理论基础.
关键词：柑橘TCP转录因子生物信息学qRT-PCR
分类号：S666.2(果树园艺)
资助基金：国家现代农业(柑橘)产业技术体系专项(CARS-27)国家科技支撑计划(2013BAD02132)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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