香蕉不同器官中microRNA差异表达分析
王静毅1
武耀廷2
刘菊华1
贾彩红1
苗红霞1
张建斌1
王卓1
金志强3
徐碧玉1
1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所·农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海口5711012.琼州大学,海南三亚,5720023.中国热带农业科学院海口实验站·海南省香蕉遗传改良重点实验室,海口570102
摘要:[目的]研究miRNA在香蕉不同器官中的表达,初步探索miRNA在香蕉生长发育过程中的可能作用.[方法]利用茎环引物的半定量和实时荧光定量PCR策略,检测香蕉中的保守miRNA,并进一步研究miRNA在香蕉根系、叶片、雄花和果实组织中的表达差异.[结果]miRNA 156d和miRNA162a具有相似的表达模式,其最高表达量均出现在雄花组织中.miR156d在雄花中的表达量(2.25)明显高于根系(0.17)、果实(0.34)和叶片(1.00);miR162a在雄花中的表达量最高,为4.36,根系组织次之,为1.72,而在叶(1.00)和果实(0.99)中的表达几乎相同.miR 164e在根系中的表达量最高,为2.37,雄花次之,为1.93,而在叶(1.00)和果实(0.98)中表达几乎相同.miR169h在4种组织中的表达量差异不明显.[结论]以香蕉各组织总RNA为模板,通过以SYBR Green为染料的Stem-loop qRT-PCR方法,成功地在香蕉根系、叶片、雄花和果实4种器官中均检测到了保守miRNA的表达,表明本研究所建立的体系是定性或定量检测香蕉植株中保守miRNA的准确而有效的方法.同时,在香蕉的不同组织中发现了具有显著表达差异的miRNA,符合miRNA在不同组织的表达活性具有多样性的规律.
关键词:香蕉MicroRNA实时荧光定量PCR表达
分类号:S668.1(果树园艺)
资助基金:国家自然科学基金(31501043)国家自然科学基金(31401843)“十二五”国家科技计划农村领域项目(2011AA10020605)海南省自然科学基金(20153116)现代农业产业技术体系建设项目(CARS-32)
论文发表日期:2016-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
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