2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析
关鹏1
曾斌2
李疆2
罗淑萍1
王建友3
李伟阳2
田嘉2
李鹏2
1.新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,8300522.新疆农业大学林学与园艺学院·新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心,乌鲁木齐8300523.中国林业科学院新疆分院,乌鲁木齐,830000
摘要：[目的]克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础.[方法]以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、ProtParam、Tmpred、SignalP、Tar-getP、SOPMA、DANMAN、MEGA6和ProtFun对推导的氨基酸序列进行分析.[结果]克隆到PtS16-RNase基因和PtS17-RNase基因,2者均属于RNase T2基因家族,与其他多种植物的S-RNase基因的序列相似度为83％～98％,序列均具有S-RNas蛋白典型结构.PtS16-RNase基因ORF长690 bp,编码229个氨基酸,PtS1 7-RNase基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸.预测2个S-RNase蛋白均为亲水性、不稳定的分泌蛋白,二级结构均以α-螺旋、延伸链和无规卷曲为主,在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,可能的主要功能为水解酶和激素.[结论]获得2个新疆野扁桃自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列.
关键词：野扁桃自交不亲和性S-RNase基因生物信息学RACE
分类号：S662.9(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31260465)林业公益性行业科研专项(201304701-1)林业公益性行业科研专项(201304701-5)新疆维吾尔自治区科技计划(201130102-1-5)新疆维吾尔自治区果树学重点学科建设项目(201007)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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