火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析
彭磊1
吴艳2
刘小翠2
杨鵾2
范付华3
文晓鹏2
1.贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院·山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,贵阳550025;贵州省安顺市农业科学院,贵州安顺5610002.贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院·山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,贵阳5500253.贵州大学林学院,贵阳,550025
摘要：[目的]克隆Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶(RT)序列并分析其特性,为火龙果遗传变异和进化研究提供新的信息.[方法]根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT保守区设计简并引物,从红肉和白肉火龙果及其突变体中扩增出430 bp左右的目标片段,回收、克隆、测序获得RT序列,并进行生物信息学分析;采用RT-PCR检测其转录活性.[结果]共获得82条RT序列,其中有55条序列发生终止密码子突变,5条序列发生移码突变;经RT序列对比,火龙果与水稻、拟南芥有较高的同源性;3条RT序列具有转录活性.[结论]火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列具有高度异质性,部分序列具有转录活性,与其他物种存在反转录转座子的横向传递.
关键词：火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶异质性转录活性
分类号：S667.9(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31560549)国家自然科学基金(31260464)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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