杧果MiCO基因的克隆与表达模式分析
徐趁
罗聪
余海霞
陈锦文
何新华
王博
方中斌
1.广西大学农学院·广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁5300042.广西大学农学院·广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁5300043.广西大学农学院·广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁5300044.广西大学农学院·广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁5300045.广西大学农学院·广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁5300046.广西大学农学院·广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁5300047.广西大学农学院·广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁530004
摘要：[目的]克隆杧果(Mangifera indica L.)MiCO基因并探讨其表达模式,为深入研究该基因的功能奠定基础.[方法]根据从杧果转录组测序数据中获得一个MiCO基因全长序列信息,设计基因全长引物,克隆具有不同开花习性的‘四季杧’和‘紫花杧’2个品种的MiCO基因全长序列,对其序列进行生物信息学分析,并利用荧光定量PCR技术对MiCO基因在杧果不同组织以及年周期的表达情况进行分析.[结果]序列分析显示,2个杧果品种的MiCO基因cDNA全长均为1 150 bp,都包含1个966 bp的开放阅读框,编码322个氨基酸,等电点为5.8,‘四季杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.30 ku,‘紫花杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.22 ku;MiCO基因编码的蛋白具有典型的CO同源蛋白结构,包括B-boxl、B-box2和CCT结构域;系统进化树表明,杧果MiCO蛋白属于第一类CO蛋白,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtCOL4相似性最高而聚类到一起.基因表达分析表明,MiCO基因在杧果不同组织中均表达,但不同组织的表达水平存在差异.年周期表达分析表明,MiCO基因在杧果成花转变期高度表达,而且在来年的5-6月还存在一个小的表达高峰期,但2个品种不同组织中MiCO基因表达存在差异.[结论]克隆获得杧果MiCO基因全长序列,发现2个具有不同开花习性的杧果品种的MiCO基因核苷酸和氨基酸序列高度同源,只存在少许差异.MiCO基因在杧果成花转变期高度表达,说明MiCO基因与杧果成花关系密切.
关键词：杧果克隆CO基因表达
分类号：S667.7(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31660561)广西自然科学基金(2013 GXNSFDA019011,2014GXNSFBAII 8102)现代农业产业技术体系(nycytxgxcxtd-06-02)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 418-426 )
英文信息