基于p23基因的野生柑橘和栽培柑橘上衰退病毒分离株间的遗传特征分析
易龙1
周常勇2
1.赣南师范大学生命与环境科学学院,江西赣州341000;中国农业科学院/西南大学柑桔研究所,重庆4007122.中国农业科学院/西南大学柑桔研究所,重庆,400712
摘要：[目的]比较分析野生柑橘与栽培柑橘上衰退病毒(CTV)分离株间的分子遗传特征,为深入解析CTV的遗传进化提供相关依据.[方法]运用RT-PCR对我国云南、广西、四川、湖南、江西等省(区)的11个野生柑橘上的CTV分离株和4个国内栽培甜橙及柚上的CTV强弱毒代表株分离株的p23基因进行扩增、测序,所获序列与GenBank收录的具有代表性的国外CTV分离株的相应基因序列进行比对分析.[结果]野生柑橘与国内外栽培柑橘上CTV分离株的p23基因序列相似率为87.7％～99.3％;密码子中碱基含量GC％＜AT％,密码子转换数多于颠换数,第3位的碱基替换数最多,其次为第1位,最少是第2位;非同义突变与同义突变的比值(dN/ds)小于1,表明p23基因在进化过程中承受着净化选择.系统聚类分析表明,来自于野生柑橘上的11个CTV分离株在构建的系统发育树中分属不同的簇支,与不同来源地具有较高相似性和较低遗传距离的栽培柑橘上的CTV分离株构成同一组群.[结论]野生柑橘与栽培柑橘上的CTV分离株在碱基含量、密码子转换和颠换率及非同义突变与同义突变比值(dN/ds)等遗传特征方面均表现出一致性,系统发育分析表明,野生柑橘上CTV分离株基于p23基因序列的聚类关系与其地理来源之间无明显相关性.
关键词：野生柑橘栽培柑橘柑橘衰退病毒p23基因遗传特征
分类号：S666(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(30900977)江西省自然科学基金(20142BAB204010)江西省高等学校科技落地计划(KJLD13079)江西省重点研发项目(20161BBF60070)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 828-834 )
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