基于EST-SSR标记的越橘栽培种和几个中国野生种的遗传结构分析
刘有春
刘成
杨艳敏
孙斌
刘硕
袁兴福
魏永祥
摘要：[目的]遗传结构分析能够提供个体的血统来源及组成信息,是遗传关系分析的重要手段.研究越橘栽培种和中国野生种的遗传结构差异,以期为我国越橘育种中野生越橘资源的发掘、利用提供遗传背景依据.[方法]筛选EST-SSR引物并对越橘属84份种质资源的基因组DNA进行PCR扩增,利用ABI 3730xl DNA遗传分析仪进行毛细管电泳分离,统计条带并计算遗传多样性指数,利用STRUCTURE软件构建遗传结构图并进行基于Nie's遗传距离的聚类分析和主成分分析.[结果]1)从54对EST-SSR引物中筛选到8对高多态性引物,共检测到101个等位变异,平均值12.63,有效等位基因数(Ne)、Shannon's多态性信息指数(I)、观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)平均值分别为8.711、2.262、0.523和0.860,多态性信息含量(PIC)为0.640～0.915,平均值为0.845,所选引物多态性高.2)贝叶斯遗传结构分析表明,当K=4时,△K最大,供试材料被划分为4个类群,类群S1主要是红豆越橘(Vaccinium vitis-idaea)和蔓越橘(V.macrocarpon),以红果类型为特征;类群S2主要是笃斯越橘(V.uliginosum),以抗寒为特征;类群S3主要包括南高丛越橘(V.corymbosum SHB)和兔眼越橘(V.ashei),以低需冷量为特征;类群S4主要包括北高丛越橘(V.corymbosumNHB)和半高丛越橘(V.corymbosum HHB),以高需冷量为特征,表明越橘种质资源内部存在明显的遗传结构差异,4个类群与材料的抗寒性、低温需冷量特性等有明显的对应关系.3)N-J聚类分析和主成分分析结果表明,野生越橘与引进的栽培品种之间亲缘关系较远.4)供试84份材料中Q值≥0.6的品种占91.67％,绝大多数供试越橘资源遗传背景较单一.[结论]从国外引进的越橘栽培种和我国野生种间存在一定程度的基因交流,不存在绝对的生殖隔离,可以通过杂交的方式获得变异植株,实现越橘种质创新和遗传基础拓宽,应加大我国野生越橘资源的发掘和利用.
关键词：越橘栽培种野生种EST-SSR标记遗传结构
分类号：S663.9(果树园艺)
论文发表日期：2017-01-01
页数：12( 956-967 )
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