甜樱桃成花相关MADS-box基因的克隆及表达分析
段续伟
倪杨
张晓明
闫国华
王晶
周宇
张开春
1.北京市林业果树科学研究院·北京市落叶果树工程技术研究中心·农业部都市农业(华北)重点实验室,北京1000932.北京市林业果树科学研究院·北京市落叶果树工程技术研究中心·农业部都市农业(华北)重点实验室,北京1000933.北京市林业果树科学研究院·北京市落叶果树工程技术研究中心·农业部都市农业(华北)重点实验室,北京1000934.北京市林业果树科学研究院·北京市落叶果树工程技术研究中心·农业部都市农业(华北)重点实验室,北京1000935.北京市林业果树科学研究院·北京市落叶果树工程技术研究中心·农业部都市农业(华北)重点实验室,北京1000936.北京市林业果树科学研究院·北京市落叶果树工程技术研究中心·农业部都市农业(华北)重点实验室,北京1000937.北京市林业果树科学研究院·北京市落叶果树工程技术研究中心·农业部都市农业(华北)重点实验室,北京100093
摘要:[目的]克隆甜樱桃中可能参与成花途径的MADS基因,分析其基本信息,研究其在不同组织中的表达情况.[方法]以甜樱桃‘萨米特’(‘Summit’)为试材,结合桃基因组分析,克隆得到14个可能参与成花的MADS基因,分别命名为PaSOC1、PaAG、PaAP1、PaAP1-2、PaAP3、PaPI、PaSVP、PaAGL24、PaSEP1、PaSEP2、PaSEP3、PaSEP4、PaSEP5、PaFLC,通过DNAMAN、SMART、protein BLAST和MEGA5等软件分析14个甜樱桃的MADS基因结构、氨基酸结构域及其进化关系,RT-PCR检测其在樱桃根、叶芽、叶、花芽、花、韧皮部中的表达模式.[结果]14个甜樱桃MADS成员大小为612~765 bp,均含有典型的MADS结构域和K-box结构域,含有6~8个内含子.分属7个亚组,PaSEP1、PaSEP2、PaSEP3、PaSEP4、PaSEP5属于SEP亚组,PaAP1、PaAP1-2属于AP1亚组,PaAG属于AG亚组,PaSOC1属于SOC1亚组,PaAP3和Pai1属于AP3/PI亚组,PaSVP属于SVP亚组,PaAGL24属于AGL24亚组,PaFLC并未聚到FLC亚组中.RT-PCR分析显示,14个MADS基因在花芽或花中均有不同程度的表达,此外,除PaAP3、PaSEP1、PaSEP4及PaSEP5之外,其他几个基因在韧皮部中也有不同程度的表达.[结论]获得的甜樱桃MADS-box基因结构高度保守,参与调控成花及花发育过程.
关键词:甜樱桃MADS-box家族基因信息学分析表达分析
分类号:S662.5(果树园艺)
资助基金:国家自然科学基金(31601726)中国博士后科学基金(2016M590063)科技创新能力建设专项(KJCX20170111)
论文发表日期:2018-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:12( 20-31 )
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果树学报

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北大核心CSTPCD
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2018,35(1)
所属栏目:种质资源·遗传育种·分子生物学