甜瓜自毒胁迫响应基因CmFe-SOD的克隆及表达分析
张政达1
王景荣1
陈丽辉1
樊佳茹1
韩晓云1
王革伏2
张志忠1
1.福建农林大学园艺学院·福建农林大学-戴尔豪西大学联合实验室,福州3500022.福建农林大学园艺学院·福建农林大学-戴尔豪西大学联合实验室,福州350002;戴尔豪西大学农学院,加拿大特鲁罗N2B5E3
摘要:[目的]克隆根系分泌物介导的甜瓜自毒胁迫响应基因Fe-SOD,分析基因序列特征和表达情况,探讨其功能.[方法]以甜瓜幼苗为材料,通过RT-PCR技术克隆Fe-SOD基因,命名为CmFe-SOD,进行生物信息学分析和亚细胞定位;通过qRT-PCR技术分析CmFe-SOD在自毒胁迫后甜瓜幼苗叶片和根系中的表达模式.[结果]CmFe-SOD基因组DNA全长1 255 bp,开放阅读框918 bp,编码305个氨基酸.生物信息学分析显示CmFe-SOD为酸性亲水蛋白,无信号肽和跨膜区域,二级结构中无规则卷曲比例最高,与三级结构预测结果一致,基因序列包含典型的Fe-SOD蛋白结构域.同源性分析表明,不同来源Fe-SOD在氨基酸序列上具有较高同源性,CmFe-SOD蛋白与黄瓜的关系较近.通过洋葱内表皮GFP荧光定位观察发现,CmFe-SOD定位于细胞质;qRT-PCR结果显示,根系分泌物处理后甜瓜幼苗叶片中CmFe-SOD基因表达水平整体呈增加趋势,在24h时表达量最高;在根系中呈现先增加后下降趋势,6h时表达量最高.[结论]CmFe-SOD基因在进化上较保守,参与了甜瓜根系分泌物介导的自毒胁迫响应,自毒胁迫后在叶片中表达量呈持续上升的趋势,在根部呈现先上升后下降的趋势.
关键词:甜瓜自毒胁迫根系分泌物Fe-SOD基因亚细胞定位qRT-PCR
分类号:S652(瓜果园艺)
资助基金:农业重大技术协同推广计划(KNJ-152046)福建农林大学创新专项基金(CXZX2016108)福建农林大学创新专项基金(CXZX2017168)
论文发表日期:2018-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 1335-1343 )
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果树学报

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北大核心CSTPCD
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2018,35(11)
所属栏目:种质资源·遗传育种·分子生物学