基于microRNA测序分析miRNA在刺葡萄抗白腐病中的作用
张颖
樊秀彩
姜建福
李民
刘崇怀
1.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州,4500092.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州,4500093.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州,4500094.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州,4500095.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州,450009
摘要：[目的]在前期的种质资源评价过程中,发掘一株中国野生刺葡萄0943,该株系高抗葡萄白腐病.基于microRNA (miRNA)在植物抗病中的重要作用,拟从miRNA水平探讨刺葡萄在受到病原菌侵染后的表达调控机制.[方法]以抗病的中国野生刺葡萄为试材,对比感病的欧亚种‘美人指’,分别以病原菌诱导,在0 hpi(hours post inoculation)和病菌诱导后的12 hpi、36 hpi处理后采样,进行二代测序,并对数据进行KEGG及表达量的差异分析.[结果]对比感病葡萄‘美人指’,分析了抗病刺葡萄在基础代谢和抗病途径中的差异,结合miRNA的表达量,获得了150个表达量发生变化的miRNA,其中44个miRNA的表达在刺葡萄和‘美人指’之间存在差异.5个miRNA在刺葡萄中特异表达,但是在‘美人指’中不表达,实施定量验证了这一结果.靶基因预测显示,其靶基因包括与抗病的紧密相关的WRKY、SPL、EFR等转录因子,还包括与抗病直接相关的LRR类的抗病基因.[结论]筛选出5个在刺葡萄上特异表达候选miRNA(miR 172a、miR172b、miR845a、novel 81和miR159a),可作为刺葡萄抗白腐病研究的目标.
关键词：葡萄白腐病microRNA抗病测序
分类号：S663.1(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31872057)创新工程项目(CAAS-ASTIP-2018-ZFRI)现代农业产业技术体系建设专项(CARS-29-yz-1)农业部作物种质资源保护项目(NB2130135-34)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 143-152 )
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