葡萄NHX基因家族的鉴定和表达分析
卢世雄
许春苗
何红红
梁国平
王萍
陈佰鸿
毛娟
1.甘肃农业大学园艺学院,兰州,7300702.甘肃农业大学园艺学院,兰州,7300703.甘肃农业大学园艺学院,兰州,7300704.甘肃农业大学园艺学院,兰州,7300705.甘肃农业大学园艺学院,兰州,7300706.甘肃农业大学园艺学院,兰州,7300707.甘肃农业大学园艺学院,兰州,730070
摘要：[目的]探究葡萄NHX基因家族生物信息学特性及在非生物胁迫下的表达情况,以期筛选出与非生物胁迫相关的家族成员,从而为葡萄抗逆性研究提供理论依据.[方法]以拟南芥、水稻及胡扬NHX基因序列为基础,对葡萄NHX基因进行同源克隆、染色体定位、氨基酸组成成分、理化性质、motif、蛋白质二级结构以及基因芯片表达等分析,同时利用qRT-PCR技术分析葡萄NHX基因家族表达情况.[结果]葡萄NHXs可分为2个亚族,主要分布在第1、5、7、14、15、19号染色体上,其外显子数为12～23个;VvNHX06的氨基酸数最少,有291个,VvNHX07的氨基酸数最多,有1 141个.Motif分析发现,N端含有典型的锌指结构,蛋白质二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.亚细胞定位预测发现,葡萄NHX基因主要分布在细胞膜、内质网、线粒体、液泡和细胞质中.基因芯片表达显示,使用NaC1、ABA和PEG处理后,葡萄叶片中VvNHX02和VvNHX06基因表达量均呈上升趋势.qRT-PCR分析结果表明,在200 mmol· L-1NaC1、100 mmol· L1ABA处理后的葡萄叶片中,VvNHX06表达量显著增加,分别是对照的30倍和60倍.用10％ PEG处理实验材料6h后,VvNHX05的表达量明显增加,是对照的5倍.[结论]VvNHX0和VvNHX06基因与植物耐盐和抗旱性有密切关系,可为葡萄的逆境胁迫机制研究提供参考.
关键词：葡萄NHX基因家族胁迫qRT-PCR
分类号：S663.1(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31460500)甘肃省科技重大专项(18ZD2NA006)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 266-276 )
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