香蕉条斑病毒ORFⅠ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析
黎维丽1
余乃通2
李俊成3
王健华4
李宾宾1
刘志昕2
1.海南大学热带农林学院,海口570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海口5711012.中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海口5711013.广东省农业科学院果树研究所·广东省热带亚热带果树研究重点实验室,广州5106404.海南大学热带农林学院,海口,570228
摘要：[目的]探明杆状DNA病毒属病毒的ORFⅠ基因功能.[方法]本研究从香蕉条斑病毒云南分离株(BSV-YN)中克隆了BSV ORFⅠ基因,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN的分类地位;对其编码蛋白及同源物的理化性质、氨基酸序列组成、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、同源结构域、蛋白二级和三级结构等进行预测和分析.[结果]BSV ORFⅠ基因片段大小为528 bp,编码175个氨基酸,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN属于BSGFV种.生物信息学分析表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白都是不稳定的、亲水性蛋白,以丝氨酸和苏氨酸磷酸化为主.这些蛋白二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,无信号肽或跨膜区域.亚细胞定位预测表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白主要在细胞核分布,推测它们在病毒感染的宿主细胞核中发挥重要作用.[结论]推测BSV-YN ORFⅠ在病毒感染的宿主细胞核中参与病毒复制、转录等相关过程.本研究为进一步开展该蛋白的功能研究提供科学线索.
关键词：香蕉条斑病毒ORFⅠ同源蛋白生物信息学分析
分类号：S668.1(果树园艺)
资助基金：国家重点实验室开放基金(2017B030314113)中国热带作物学会青年人才托举工程(CSTC-QN201704)中国热带农科院基本科研业务费专项(No.19CXTD-33)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 557-566 )
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