miR403分子进化特性及其在龙眼体胚发生早期的表达模式分析
苏立遥
蒋梦琦
黄倏祺
徐小萍
厉雪
陈旭
赖钟雄
林玉玲
1.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,3500022.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,3500023.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,3500024.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,3500025.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,3500026.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,3500027.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,3500028.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州,350002
摘要：[目的]探究miR403的分子进化特性及其在龙眼体胚发生早期中的表达模式.[方法]根据龙眼转录组数据库结合miRBase数据库下载得到植物miR403成熟体(miRNA,MicroRNA)和前体(pre-miRNA,Precursor MicroRNA)序列,对其构建系统发育树、序列多重比对、前体二级结构分析;并克隆龙眼miR403 5’末端cDNA序列,比较miR403启动子顺式作用元件.利用qPCR(Quantitative real time-PCR)探究龙眼体胚发生早期miR403和pre-miR403的表达模式.[结果]龙眼及其他17个物种中miR403的36个前体和42成熟体序列的系统发育树以及序列多重比对显示,植物miR403高度保守且主要来源于pre-miR403的3臂,而pre-miR403分歧较大,序列仅在miRNA生成区域保守;不同物种之间miR403成员数量差异不大;pre-miR403最小折叠自由能为-35.70 ～-55.50 kal·mol-1.克隆获得龙眼pri-miR403(miR403初级体)5’末端cDNA序列,确认其第一个碱基A为转录起始位点(TSS,transcription start site).龙眼等5种植物MIR403启动子中具有大量光、激素和逆境胁迫等元件.龙眼早期体胚发生过程中miR403和pre-miR403整体为显著下调趋势.[结论]龙眼miR403与其他植物miR403具有高度的保守性以及物种之间的特异性,miR403和pre-miR403下调表达可能有利于促进龙眼早期体胚发生.
关键词：龙眼microRNA403进化特性启动子体胚发生表达分析
分类号：S667.2(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31672127)福建省高原学科建设经费(102/71201801101)福建农林大学园艺学院优秀硕士学位论文资助基金(2018S02)
论文发表日期：2019-07-02
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 846-856 )
英文信息