苹果锈果类病毒火焰海棠分离物全基因组克隆及序列分析
张富军1
张振鲁1
张蕊芬2
王寻1
由春香1
郝玉金1
1.山东农业大学园艺科学与工程学院·作物生物学国家重点实验室,山东泰安2710182.青岛市农业科学研究院,山东青岛,266000
摘要：[目的]检测从山东青岛采集的有“花脸”症状的火焰海棠(Malus‘Flame’)果实是否带有苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd).[方法]提取带有“花脸”症状的火焰海棠果皮总RNA,设计ASSVd特异性引物,利用RT-PCR方法进行检测.设计基因特异性引物扩增ASSVd基因组全长,并进行克隆、测序,利用CLC RNA Workbench4预测其二级结构.用DANMAN软件比对来自中国不同地区、不同寄主的苹果锈果类病毒分离物基因序列.用MEGA-7软件分析山东火焰海棠ASSVd分离物与来自不同国家、不同寄主ASSVd分离物的遗传关系.[结果]从山东青岛采集的表现“花脸”症状的火焰海棠果皮中检测到ASSVd,推测火焰海棠果皮的“花脸”症状可能由ASSVd引起.利用基因特异性引物克隆4条ASSVd基因组全长序列,其长度为333～334 bp,在GenBank的登录号依次为MK 102981-MK 102984.ASSVd序列比对结果显示,来源于不同寄主的分离物存在差异.系统进化树显示ASSVd不存在明显的地区专化性,进一步对ASSVd二级结构分析发现不同寄主的ASSVd致病区(P)存在明显的差异.[结论]从山东青岛采集的带有“花脸”症状的火焰海棠果实带有ASSVd.本研究从火焰海棠检测到ASSVd,明确其为自然寄主之一,且火焰海棠果实的“花脸”症状形成可能与ASSVd侵染有关.
关键词：火焰海棠苹果锈果类病毒序列分析寄主特异性
分类号：S661.1(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31772288)国家现代苹果产业技术体系项目(CARS-27)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 1005-1012 )
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