甜樱桃品种中新多态性SSR的鉴定、指纹图谱构建及聚类分析
王晶
张开春
张晓明
闫国华
周宇
段续伟
陈玲
北京市林业果树科学研究院,北京100093;农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京100093;北京市落叶果树工程技术研究中心,北京100093
摘要：[目的]应对迅速增加的甜樱桃品种及其分子鉴定需求,储备一批新多态性SSR,并获得其在甜樱桃品种中的基因型数据.[方法]从甜樱桃基因组测序开发的SSR库中,根据重复单元和重复次数在8条染色体上一共选择了96个SSR.用ABI3730,鉴定出其中9个SSR在4个代表甜樱桃品种中具有多态性.另外从305个李属SSR中又鉴定出9个多态性SSR.用S基因和多态性SSR排除了52个品种122个单株中S基因型不正确和混杂的品种或单株,然后用多态性信息比价高的11个SSR(其中包括8个新SSR)和S基因标记,构建了48个甜樱桃品种的指纹图谱库,并获得了可以区分48个品种的最少标记组合.[结果]聚类分析表明,48个甜樱桃品种组成了短低温组、中国组、北美组和东欧组.聚类分析结果可以和品种间亲缘关系及地域来源互相验证.[结论]鉴定了3个从未报道的甜樱桃品种的S基因型,验证了一种可以有效获得多态性SSR的途径,提供了9个新的多态性SSR及其等位基因大小,用12个分子标记构建了48个甜樱桃品种指纹图谱.本文提供的新SSR及其构建的甜樱桃品种指纹图谱真实可靠.
关键词：甜樱桃SSR指纹图谱S基因型
分类号：S662.5(果树园艺)
资助基金：北京市农林科学院协同创新专项(KJCX201910)科技创新能力建设专项(KJCX20161504)科技创新能力建设专项(KJCX20170111)国家自然科学基金(31601726)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 1619-1629 )
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