miR395分子进化特性及其在龙眼早期体胚发生中的表达分析
黄倏祺
苏立遥
蒋梦琦
赖钟雄
林玉玲
1.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州3500022.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州3500023.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州3500024.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州3500025.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州350002
摘要：[目的]研究miR395的分子进化特性及其在龙眼早期体胚发生中的表达分析.[方法]通过龙眼miRNA文库、转录组数据库和miRBase数据库,得到所有植物miR395家族成员成熟体和前体序列,对其进行序列比对及进化分析、保守性分析、前体二级结构预测、潜在靶基因预测,对龙眼miR395a在龙眼早期体胚发生(SE)阶段的表达模式进行分析.[结果]龙眼miR395家族包含5条前体序列和2条成熟体序列.Mfold预测分析发现,龙眼pre-miR395序列均能形成稳定的发卡结构,其最小折叠自由能△G在-44.70～64.80 kal.mol-,提示与序列长度没有显著相关性.其次,保守性分析显示,植物pre-miR395两端序列较保守,而中间序列不保守;系统进化分析提示,龙眼pre-miR395家族与脐橙、葡萄和苹果的亲缘关系更近.psRNAtarget预测显示,龙眼miR395调控的潜在靶基因主要包含富含亮氨酸重复受体蛋白激酶LRR-RLKs、ATP硫酸化酶APS1、蛋白磷酸酶PP2C、前体RNA蛋白质TSR1同系物TSR1、酮酯酰CoA硫解酶KAT2和EH结构域蛋白EHD1等6个,且都是以裂解靶标的方式进行调控.qRT-PCR分析表明,在龙眼早期体胚发生阶段,miR395a呈上调趋势,且miR395a与APS1呈显著负相关.[结论]龙眼miR395与其他植物miR395功能具有高度保守性和物种特异性,同时龙眼miR395a上调表达可能促进龙眼球形胚的形态建成.
关键词：龙眼miRNA395进化特性早期体胚发生实时荧光定量PCR
分类号：S667.2(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31672127)福建省高原学科建设经费(102/71201801101)福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2018078)福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2017314)
论文发表日期：2020-01-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 18-28 )
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