石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析
骆翔
曹尚银
李好先
赵弟广
张富红
陈丽娜
Krishna Poudel
敬丹
唐丽颖
1.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500092.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500093.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500094.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500095.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500096.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500097.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500098.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州4500099.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州450009
摘要：[目的]对石榴SUT家族基因成员进行全基因组鉴定,并分析SUT家族基因成员的结构域特征、启动子序列、生化特征、进化关系和表达特性,为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考.[方法]利用同源比对及HMMER模型鉴定石榴SUT基因家族成员;利用邻近法和基因结构分析解析石榴SUT基因及其启动子序列的系统发生关系.[结果]共鉴定了10个石榴SUT基因,可以分为3大类;石榴SUT基因及其启动子区的GC含量都明显低于其在拟南芥和水稻中的含量;石榴SUT家族基因GC含量远高于启动子区的GC含量;石榴SUT基因的序列长度与GC含量呈明显正相关;石榴SUT基因启动子区含有10种MYB元件;此外,4个石榴SUT基因(PgL0328370.1、PgL0099690.1、PgL0145810.1和PgL014770.1)在籽粒发育过程中发生了差异表达.[结论]SUT基因在进化过程中其序列和基因结构相对保守,而其启动子序列在进化过程中变化较大,SUT基因的表达量变化与籽粒发育显著相关.
关键词：石榴SUT基因家族籽粒表达分析
分类号：S66(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31901343)创新工程项目(CAAS-ASTIP-2016-ZFRI-03)
论文发表日期：2020-04-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 485-494 )
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