基于转录组测序分析NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根糖酵解相关基因的表达
何晨晨
刘俐君
鲁晓燕
1.石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320002.石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子8320003.石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子832000
摘要：[目的]筛选新疆野苹果响应NaCl胁迫相关基因.[方法]以新疆野苹果组培苗为试验材料,对150 mmol· L-1NaCl处理48 h后的新疆野苹果幼苗叶片及根系进行转录组测序.[结果]与对照相比,NaCl处理48 h时,新疆野苹果幼苗叶片中差异表达基因为3 364个,其中1 745个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,1 619个DEGs下调表达;根系中差异表达基因为3 808个,其中1 057个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,2 751个DEGs下调表达.新疆野苹果叶片和根系中所共有的差异基因有2 095个得到注释,这些基因共涉及44个Pathway,富集最显著的Pathway主要有糖酵解/糖异生、磷酸戊糖途径、果糖和甘露糖代谢、丙酮酸代谢等.[结论]通过转录组测序和qRT-PCR验证发现,新疆野苹果受到NaCl胁迫后,在糖酵解过程中TPI、FBPase、pckA、PPDK等基因表达量发生明显变化,说明糖酵解途径在新疆野苹果应答NaCl胁迫过程中起着一定的作用.
关键词：新疆野苹果NaCl胁迫转录组测序糖酵解
分类号：S661.1(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金委NSFC-新疆联合基金(培育)项目(U1703116)
论文发表日期：2020-07-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 951-961 )
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