中华猕猴桃fasciclin基因家族生物信息学分析及克隆
周婉莹1
曲东1
张晓娟1
张文慧2
刘艳飞3
张羽1
1.陕西理工大学生物科学与工程学院,陕西汉中7230002.安康市农业科学研究院,陕西安康7250003.西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100
摘要：[目的]探讨asciclin基因在中华猕猴桃中的生物信息.[方法]对中华猕猴桃雌株38个asciclin基因进行生物信息学分析和克隆其中一个与性别相关的asciclin基因.[结果]38个asciclin基因编码133～606个氨基酸.丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点范围分别为10～56个、2～26个、0～8个.38个fasciclm基因拥有1～9个motif结构(取值10),其中Motif3为共同具有.68.42％ fasciclin蛋白为不稳定疏水性蛋白.2 000 bp启动子区共预测到TFs 110个,较多的TFs依次为BBR-BPC、TALE和AP2,9个基因没有预测到TFs结合位点.UPGMA聚类法把38个fasciclin蛋白分成2类.基因克隆序列(723 bp)具有fasciclin保守结构域,该序列只比对到8号染色体上.[结论]fasciclin基因保守性不强;克隆序列与中华猕猴桃雌雄性状显著关联,但与美味猕猴桃雌雄无关联;雌株中的同源区没有注释到基因.
关键词：猕猴桃Fasciclin生物信息性别克隆
分类号：S663.4(果树园艺)
资助基金：陕西省科技厅农业重大项目(17JS022)陕西省科技厅农业重大项目(K3370219025)
论文发表日期：2020-08-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：12( 1144-1155 )
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