板栗PPO基因家族鉴定及生物信息学分析
程丽莉1
程运河1
曹庆昌1
胡广隆2
兰彦平1
1.北京市林业果树科学研究院,北京100093;国家林草局板栗工程技术研究中心,北京1000932.北京市林业果树科学研究院,北京100093
摘要：[目的]褐变过程与多酚氧化酶(Polyphenol oxidases,PPO)密切相关,通过板栗PPO基因家族鉴定及生物信息学分析,为深入阐明PPO蛋白质的功能提供依据.[方法]从最新发布的板栗基因组数据库中鉴定到3个PPO基因:CmPPO1 (BUA.CMHB Y222345)、CmPPO2(BUA.CMHB Y216654)、CmPPO3(BUA.CMHBY216989),并利用生物信息学方法,对其序列和基因编码蛋白的理化性质、结构功能等进行预测.[结果](1)3个基因的CDS全长分别是1 794、1 809和1 809 bp,分别编码氨基酸序列597、602和602aa,属于亲水酸性蛋白质,不存在跨膜区,为非分泌蛋白.(2)CmPPOs蛋白酶的二级结构无规则卷曲比例最高,三级空间结构模型分析与蔷薇科苹果酪氨酸酶结构(MdPPO1)序列同源性超过70％.(3)对苹果、马铃薯和板栗3个易褐变物种的23个PPO基因编码蛋白进行多序列比对和保守结构域分析,明确板栗PPO和蔷薇科苹果有较高同源性.(4)对不同品种板栗仁中的PPO基因进行表达分析,只检测到CmPPO1,且表达量与酶活性相关性不显著,表明板栗仁中PPO活性不能直接影响褐变程度,不同品种褐变程度与PPO表达量呈显著相关.[结论]板栗PPO基因家族3个成员中,不同品种CmPPO1表达量与果实受热褐变程度呈显著相关.本研究为板栗抗褐变育种提供了新的基因资源,但鉴于PPO存在同工酶,表达调控机制比较复杂,特异表达和时空差异性有待进一步研究.
关键词：板栗果实PPO基因家族生物信息学
分类号：S664.2(果树园艺)
资助基金：国家重点研发计划(2018YFD1000605)北京市农林科学院青年科研基金(QNJJ201703)
论文发表日期：2020-09-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 1305-1313 )
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