菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析
阮城城1
胡福初2
罗志文2
王祥和2
郭利军2
李玉静2
范鸿雁2
韩冰2
陈哲2
张治礼2
1.海南省农业科学院热带果树研究所·海南省热带果树生物学重点实验室·农业部海口热带果树科学观测实验站,海口571100;海南大学热带作物学院,海口5702282.海南省农业科学院热带果树研究所·海南省热带果树生物学重点实验室·农业部海口热带果树科学观测实验站,海口571100
摘要：[目的]筛选并分析菠萝TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,为菠萝TCP基因在乙烯利诱花过程中的功能研究提供参考.[方法]以'台农16号'菠萝为材料,通过生物信息学软件系统地分析该基因家族的蛋白质理化性质、染色体定位、基因共线性、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及RNA-Seq数据,并通过qRT-PCR分析该基因家族在成花诱导阶段的表达情况.[结果]共鉴定出9个菠萝TCP基因,均含有TCP结构域,系统进化将其划分为PCF、CIN和CYC/TB1三个亚家族.菠萝TCP基因家族的扩增与全基因组倍增事件无关,不存在片段复制和串联复制事件.启动子顺式作用元件分析发现,AcTCP2、AcTCP5?AcTCP9均含有乙烯响应元件.表达谱分析表明,AcTCP对乙烯利均有不同程度的响应,在花芽分化时期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在茎尖中的表达水平均有显著上调,分别约为0时期的8.15、18.0、14.6和7.91倍.[结论]鉴定并分析了AcTCP基因家族成员信息,发现AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在花芽分化时期高度表达,AcTCP3在乙烯利处理1 h后显著上调,表明其可能与乙烯利诱导菠萝成花过程密切相关.
关键词：菠萝TCP基因基因家族表达分析
分类号：S668.3(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31960589)海南省科协青年科技英才学术创新计划(QCXM201803)科研院所技术开发专项(KYYS-2018-02)
论文发表日期：2020-11-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：13( 1623-1635 )
英文信息