香蕉GRF基因家族的全基因组鉴定及表达分析
田娜
刘范
伍俊为
刘嘉鹏
李丹
付帅
黄玉吉
程春振
1.福建农林大学园艺学院?园艺植物生物工程研究所,福州3500022.福建农林大学园艺学院?园艺植物生物工程研究所,福州3500023.福建农林大学园艺学院?园艺植物生物工程研究所,福州3500024.福建农林大学园艺学院?园艺植物生物工程研究所,福州3500025.福建农林大学园艺学院?园艺植物生物工程研究所,福州3500026.福建农林大学园艺学院?园艺植物生物工程研究所,福州3500027.福建农林大学园艺学院?园艺植物生物工程研究所,福州3500028.福建农林大学园艺学院?园艺植物生物工程研究所,福州350002
摘要:[目的]生长调控因子(Growth-regulating factors,GRF)是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育和抗逆防御过程中发挥着重要作用.为揭示香蕉GFR基因等功能,对小果野蕉生长调控因子(MaGRF)基因家族进行全基因组鉴定和分析,并研究其在香蕉果实成熟和低温胁迫应答过程中的表达模式.[方法]使用生物信息学软件对MaGRFs家族成员进行全基因组鉴定和分析,基于转录组数据分析MaGRFs在自然成熟和乙烯催熟的香蕉果实成熟过程及4 ℃低温处理叶片中的表达情况.[结果]共鉴定获得可归为4个亚家族的20个MaGRF成员,其中15个成员被预测为miR-NA396的靶基因.MaGRFs启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育相关的顺式作用元件和9种转录因子家族的结合位点.转录组结果显示,MaGRF7在自然成熟的果实中高水平表达;MaGRF13在自然成熟和乙烯催熟的果实中均高表达;属于第I和第II亚家族的多个MaGRFs在果实成熟过程中差异表达显著;低温处理显著诱导MaGRF9、14、15、18和19的表达,显著抑制MaGRF2、6和13的表达.[结论]香蕉GRF家族成员较多,它们的表达大多受miR396调控.第I和第II亚家族的MaGRF成员在香蕉果实成熟和低温应答过程中发挥着重要作用.
关键词:香蕉生长调控因子果实成熟温度胁迫表达模式
分类号:S668.1(果树园艺)
资助基金:国家重点研发计划(2019YFD1000901)国家自然科学基金(31701900)国家自然科学基金(31601713)福建农林大学校杰出青年科研人才计划项目(xjq201721)现代农业产业技术体系建设专项(CARS-32-11)福建省高原学科建设经费(102/71201801101)
论文发表日期:2020-12-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:15( 1821-1835 )
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