核桃NAC基因家族的全基因组鉴定与分析
亢超
郭彩华
张雪蒙
刘金明
袁星
全绍文
牛建新
摘要:[目的]探究核桃中的NAC转录因子及其在花器官形成过程中的表达特性.[方法]利用转录组和基因组数据库,结合生物信息学方法,对核桃N4C基因家族进行鉴定,并就其理化性质、亚细胞定位、系统发育、基因结构、保守基序、染色体定位、基因复制及蛋白调控网络进行分析.[结果]核桃中共鉴定到121个NAC家族成员,它们在16条染色体上不均等分布,根据系统发育树,核桃所有NAC成员被分为15个亚族;基因结构显示,大部分JrNAC成员含有3个外显子;共线性分析表明,核桃中有4个NAC基因在其他3个物种中均具有同源基因,且其中的2个基因(JrNAC44和 JrNAC108)在核桃基因组中出现基因复制现象.基因表达分析显示,7个JrNAC基因在雌雄花芽的3个时期均高表达,特别是JrNAC8和JrNAC115.[结论]核桃NAC基因较为保守,但仍发挥多样性的功能.JrNAC2、JrNAC8、Jr-NAC115和JrNAC97基因可能为核桃花器官发育过程中的关键基因.
关键词:核桃NAC基因家族生物信息学表达模式
分类号:S664.1(果树园艺)
论文发表日期:2021-09-28
页数:15( 1444-1458 )
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果树学报

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CSTPCD北大核心
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2021,38(9)
所属栏目:种质资源·遗传育种·分子生物学