沃柑果皮响应柑橘锈螨危害的转录组分析
田帅
邱发发
葛聪聪
黄桂香
王国全
广西农业环境与农产品安全重点实验室·植物科学国家级实验教学示范中心·广西大学农学院,南宁530004
摘要：[目的]揭示柑橘抗柑橘锈螨危害的分子机制,筛选出在柑橘锈螨危害条件下的相关应答基因.[方法]研究以接种柑橘锈螨后危害3、5、7、9d的沃柑果实为试材,健康果实为对照(CK),采用Novaseq6000平台进行转录组双向测序,并对数据进行生物信息学相关性分析.[结果]共获得了 55.63 Gb clean bases,去除低质量碱基和接头序列后,CK3、CK5、CK7和CK9获得Cleanreads分别是42 115 939、45 501 683、58 118 008和40 715 511 条,WG3d、WG5d、WG7d和WG9d获得Clean reads分别是46 807 089、49 185 798、44 437 798和44 035 730条.柑橘锈螨危害3、5、7、9 d后引起上调差异表达基因数量分别为2764、1812、3217、2778个,下调差异表达基因数量分别为3036、1387、3350、2347个.GO功能富集分析结果显示,差异表达基因在不同的柑橘锈螨危害时间段,主要集中在生物学过程、细胞组分和分子功能中.KEGG注释分析结果显示,差异表达基因主要参与二苯乙烯、二芳基庚烷和姜辣素的生物合成、核糖体、磷酸戊糖、光合作用、碳代谢等途径.[结论]植物激素信号转导、植物病原互作通路、类黄酮生物合成、苯丙氨酸代谢、戊糖磷酸代谢5条通路在沃柑响应柑橘锈螨胁迫过程中起到了重要的调控作用.
关键词：沃柑柑橘锈螨转录组差异表达基因
分类号：S666(果树园艺)S436.661(病虫害及其防治)
资助基金：国家重点研发计划(2018YFD0201500)广西壮族自治区科技重大专项(AA17204026)广西现代农业产业技术体系建设项目柑橘创新团队项目(nycytxgxcxtd-05-08)
论文发表日期：2021-09-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 1569-1578 )
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