梨自交不亲和基因克隆及其进化分析
梁文杰1
谭晓风2
乌云塔娜3
1.温州科技职业学院,浙江温州3250062.中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙4100043.中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004;中国林业科学研究院经济林研究开发中心,郑州450003
摘要:[目的]获得梨S-RNase基因全长序列及其进化、遗传多态性情况.[方法]设计特异性引物扩增梨S42-RNase基因组DNA全长序列,利用RT-PCR结合cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得其cDNA全长序列.构建梨属植物S-RNase基因编码区和高变区(hyper variable region,HV)内含子的系统发育树.[结果]梨S42-RNase基因编码226个氨基酸,包含由27个氨基酸组成的信号肽,由11、11、6、8、7个氨基酸组成的5个保守区以及HV区插入的335 bp内含子序列.系统进化树显示,梨S-RNase基因编码区和HV区内含子的拓扑结构既相似又有差异.编码区Normalized dN-dS结果显示,除了HV区外还有几个区域存在大量的非同义替换,表明对阳性选择具有很高的敏感性.[结论]梨S-RNase基因编码区和HV区内含子的进化存在一定的关联性,除HV区外还存在其他区域参与梨雌蕊与花粉间特异识别.梨S-RNase基因编码区进化动力源自其编码特异识别蛋白的功能,是平衡选择的结果.HV区的内含子序列表现出很高的长度多态性,进化受到负选择的压力.
关键词:S-RNase基因克隆进化分析
分类号:S661.2(果树园艺)
资助基金:国家自然科学基金(31000309)
论文发表日期:2021-10-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:17( 1621-1637 )
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果树学报

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CSTPCD北大核心
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2021,38(10)
所属栏目:种质资源·遗传育种·分子生物学