干旱胁迫下葡萄AQP基因家族的鉴定及转录调控网络预测
杨盛迪
郭大龙
裴茂松
刘海楠
韦同路
余义和
河南科技大学园艺与植物保护学院,河南洛阳471023;河南省园艺植物品质调控工程技术研究中心,河南洛阳471023
摘要：[目的]探究干旱胁迫下葡萄AQP的转录调控网络,为后续研究葡萄抗旱基因功能和转录调控机制提供理论依据.[方法]通过生物信息学方法分析葡萄AQP基因家族成员的理化性质、系统进化和染色体定位,进行共线性分析和转录因子调控预测,通过转录组数据分析该基因家族在干旱胁迫和脱落酸(abscisic acid,ABA)处理下的表达情况.[结果]37个VvAQP基因主要分为PIP、TIP、NIP、SIP四类,分别分布在17条染色体上,复制分析结果表明,共有5对节段复制和2对串联复制.蛋白序列分析表明,每个VvAQP蛋白序列中均有1个植物AQP主要内在蛋白(major in-trinsic proteins,MIP)的保守结构域特征.通过转录调控网络预测发现,靶向VvAQP基因的转录调控因子主要分为16类.干旱胁迫下,根和叶中大部分VvAQP基因表达持续下调,VvPIP2-3、VvPIP2-6在根中持续上调,7个VvAQP基因受ABA显著诱导.干旱胁迫下15个差异表达的转录因子可能与13个VvAQP基因存在调控关系.[结论]鉴定并提供了葡萄AQP基因家族成员的基本信息,通过转录组数据发现可能参与干旱胁迫的VvAQP基因,并预测了这些基因的转录调控网络.
关键词：葡萄AQP干旱胁迫转录因子调控
分类号：S663.1(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31701893)河南省高校科技创新人才计划(21HASTIT035)河南省高等学校科技创新团队支持计划(21IRT-STHN021)河南省高等学校青年骨干教师培养计划(No.81)洛阳市科技发展计划(2101102A)
论文发表日期：2021-10-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：15( 1638-1652 )
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