对萼猕猴桃CDPK基因家族鉴定及非生物胁迫应答分析
张永杰
白丹凤
Muhammad Abid
李志
方金豹
钟云鹏
中国农业科学院郑州果树研究所·果树生长发育与质量控制重点实验室,郑州450009
摘要:[目的]鉴定对萼猕猴桃(Actinidia valvata)CDPK家族基因,并分析其在不同组织的表达模式以及对盐胁迫和淹水胁迫的响应.[方法]基于3代全长转录组测序数据,通过多种生物信息学手段,分析和鉴定对萼猕猴桃CDPK家族基因,利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术分析这些基因在不同组织中的表达,及在不同非生物胁迫条件下的表达情况.[结果]在对萼猕猴桃基因型KR5的全长转录组测序数据中共鉴定出63个CDPK基因,命名为AvCDPK1~AvCDPK63.系统发育分析将AvCDPK基因蛋白分为4个亚家族,同一亚家族具有相似的结构和基序(motif).AvCDPK基因存在明显的组织表达特异性.AvCDPK49在盐胁迫和淹水胁迫条件下,均显著诱导表达,AvCDPK30和31在2种胁迫下均显著抑制表达.[结论]在对萼猕猴桃中共鉴定出63个CDPK基因,系统发育树显示AvCDPK基因家族与拟南芥CDPK基因家族在进化上高度保守.不同组织中AvCDPK的表达量存在明显差异,其中AvCDPK49受盐害、淹水诱导显著高表达,表明其可能在猕猴桃的耐盐和耐涝响应过程中发挥着重要作用.
关键词:对萼猕猴桃全长转录组CDPK基因家族盐胁迫淹水胁迫
分类号:S663.4(果树园艺)
资助基金:国家自然科学基金(31801846)创新工程项目(CAAS-ASTIP-2020-ZFRI)国家成都农业科技中心项目(NASC2020AR07)中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(Y2019LM13)
论文发表日期:2021-10-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:15( 1653-1667 )
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