基于SSR标记的中亚生态区核桃(Juglans regia L.)遗传多样性与种群结构分析
马凯1
赵钰1
张恒2
韩立群1
赵国庆1
王继勋1
1.新疆农业科学院园艺作物研究所,乌鲁木齐830091;农业农村部新疆地区果树科学观测试验站,乌鲁木齐830091;新疆园艺作物基因组与遗传改良重点实验室,乌鲁木齐8300912.新疆农业科学院国际科技合作交流处,乌鲁木齐830091
摘要：[目的]从分子水平探究中国新疆与吉尔吉斯斯坦和塔吉克斯坦2个中亚国家共6个区域核桃种质资源间的遗传多样性及亲缘关系.[方法]采用SSR分子标记方法对采自6个区域的137份核桃种质资源进行遗传多样性和居群遗传结构分析.[结果]利用14对引物共检测到130个等位变异位点,变异范围为6～13,平均每对SSR引物可检测到9.2857个等位位点;14个SSR位点的占比范围为0.6257～0.865 l,平均值0.7634;平均Shannon's多样性指数(I)为0.4598;种群总基因多样性(Ht)平均值为3.2481;种群内基因多样性(Hs)平均值为2.1089;种群间的遗传分化指数(Gst)范围为0.0578～0.4068,平均值为0.2595;基因流(nm)平均值为3.0174;各个等位基因频率整体分布不均匀.UPGMA聚类结果显示,137份供试材料在遗传相似性系数为0.75时分成3个类群.其中,第一类群共42份,包括中国新疆阿克苏地区16份,中国新疆和田地区21份,吉尔吉斯斯坦5份;第二类群共44份,包括中国新疆伊犁地区12份、吉尔吉斯斯坦32份;第三类群共51份,包括中国新疆喀什地区19份、塔吉克斯坦13份和中国新疆伊犁地区19份.聚类结果在一定程度上表明了居群间亲缘关系的距离,总体分布与地理分布有关,不同区域之间存在一定的基因交换.聚类结果与居群间遗传距离和遗传一致度结果一致.[结论]SSR分子标记结果表明,中亚生态区不同地理分布的核桃种质资源遗传多样性存在差异,为揭示中亚生态区核桃种群结构及传播途径提供了依据.
关键词：核桃种质资源SSR遗传多样性遗传结构
分类号：S664.1(果树园艺)
资助基金：新疆维吾尔自治区天山青年计划项目(2020Q031)新疆维吾尔自治区资源共享平台建设项目(PT2027)新疆维吾尔自治区区域协同创新专项上海合作组织科技伙伴计划(2018E01001)
论文发表日期：2021-11-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：14( 1854-1867 )
英文信息