沃柑辐射诱变系渝沃无核的果实品质及遗传差异分析
彭洁1
余歆2
朱延松1
杨胜男1
程莉1
李仁静1
江东2
1.西南大学柑桔研究所,重庆4007122.西南大学柑桔研究所,重庆400712;中国农业科学院柑桔研究所,重庆400712
摘要：[目的]从果实品质和分子水平上解析造成沃柑辐射诱变系渝沃无核重要表型差异的主要遗传因素,为后续柑橘品种遗传改良奠定基础.[方法]观测渝沃无核的果实品质,应用RNA-seq技术和全基因组重测序揭示渝沃无核的差异表达基因(differential expression genes,DEGs)及基因组的遗传差异.[结果]相比沃柑,渝沃无核的种子数量少、成熟期提前、果皮变厚和剥皮较难,其可溶性固形物含量、固酸比和抗坏血酸含量高,可滴定酸、转化糖含量低.渝沃无核的串联重复序列占基因组的3.44％,其所在位置基因的GO功能富集和KEGG通路富集主要涉及代谢过程和次生代谢物合成,其中只涉及RNA聚合酶活性、与物质的跨膜运动有关的ATPase活性、半乳糖代谢和过氧化物酶途径.DEGs的GO功能富集涉及碳水化合物代谢、氧化还原过程和β-半乳糖苷酶复合物,KEGG通路富集涉及苯丙素生物合成、内质网蛋白加工和次生代谢物合成.[结论]渝沃无核成熟期早,种子数量少,品质更优.渝沃无核与沃柑的串联重复序列的数目和位置存在差异;苯丙素生物合成、内质网蛋白加工、次生代谢物合成、糖代谢和植物激素有关途径及花粉相关DEGs存在差异.
关键词：渝沃无核果实品质RNA-seq全基因组重测序遗传差异
分类号：S666.1(果树园艺)
资助基金：国家重点研发计划(2018YFD1000101)果树优质高效品种筛选及配套栽培技术研究(2019YFD1001400)
论文发表日期：2021-12-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：16( 2119-2134 )
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