枳PP2C基因家族的鉴定及表达分析
杨杰1
陈蓉1
胡文娟1
吴巧玲1
佟晓楠2
李兴涛2
1.赣南师范大学生命科学学院,江西赣州3410002.赣南师范大学生命科学学院,江西赣州341000;国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州341000
摘要：[目的]鉴定枳(Poncirus trifoliata)PP2C基因家族,并分析其在不同组织的表达模式以及对低温、高温和干旱胁迫的响应.[方法]利用生物信息学方法在枳基因组中鉴定PP2C基因家族,分析其理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、保守基序、基因复制及启动子顺式作用元件等,并采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)方法检测PtrPP2C基因家族成员在不同非生物胁迫处理下的表达情况.[结果]枳中共鉴定出可聚类为10个亚族的53个PP2C基因,命名为PtrPP2C1～PtrPP2C53,其编码蛋白的氨基酸数介于235～1184aa之间,分子质量为25.90～127.95 ku;这些基因分布于枳的10条染色体上,均具有保守的PP2C蛋白结构域.PtrPP2Cs启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育相关的顺式作用元件.转录组数据分析结果显示,不同组织中PtrPP2Cs的相对表达量存在明显差异,总体上分为特异性表达和普遍性表达.qRT-PCR结果显示,在低温、高温和干旱胁迫处理条件下的12h内,与对照相比分别有10、8和9个基因均持续上调表达;其中,PtrPP2C29较明显,其在(4±1)℃低温处理下的相对表达量是对照的56.8倍,在(38.0±0.5)℃C高温处理下的相对表达量与对照相比显著上调,是对照的195.1倍,在干旱处理条件下的相对表达量是对照的5.1倍.[结论]从枳基因组中鉴定出53个PP2C基因家族成员,具有明显的组织表达特异性,并参与多种非生物胁迫应答.研究结果为进一步探究枳PP2C基因家族提供了参考.
关键词：枳PP2C基因家族生物信息学表达模式
分类号：S666(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(32160731)江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ190758)江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ180758)
论文发表日期：2022-04-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：16( 532-547 )
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