欧李NAC基因家族的鉴定及表达分析
张忠鑫
郭夕雯
汪泽文
王鹏飞
张建成
杜俊杰
穆霄鹏
山西农业大学园艺学院,山西太谷 030801
摘要：[目的]对ChNAC基因进行鉴定并分析其表达模式,明晰ChNAC基因结构,预测其潜在功能,筛选抗逆相关基因,为欧李抗逆性状形成的分子机制研究提供理论依据.[方法]在全基因组数据的基础上对ChNAC基因进行生物信息学分析,并对不同非生物胁迫处理下ChNAC基因的转录组数据进行分析.[结果]欧李NAC基因家族有76个家族成员,33个ChNAC基因编码碱性氨基酸,17个ChNAC基因编码酸性氨基酸,26个ChNAC基因编码中性氨基酸.ChNAC蛋白均为亲水性蛋白,80％ChNAC蛋白为不稳定蛋白,79％ChNAC蛋白定位于细胞核中.ChNAC基因可分为17个亚族,主要为OsNAC7、ANAC001、ONAC003等亚族.ChNAC基因多存在于Chr5染色体上,有8对ChNAC基因由染色体大片段复制而来,其中ChNAC01、ChNAC20、ChNAC64这3条基因是互为共线性.启动子分析结果表明ChNAC基因可能参与欧李的生长发育、激素调控及胁迫响应等方面.[结论]ChNAC基因的表达具有组织特异性.ChNAC基因家族成员响应不同的胁迫处理,尤其是ChNAC49基因在盐胁迫、干旱胁迫、低温胁迫和高温胁迫中均显著上调表达,推测其可能在欧李抗逆过程中发挥核心作用.
关键词：欧李ChNAC基因家族生物信息学分析表达模式
分类号：S662.3(果树园艺)
资助基金：山西省优秀博士来晋工作奖励资金科研项目(SXYBKY2018041)山西农业大学科技创新博士科研启动基金项目(2018YJ06)中国博士后科学基金面上项目(2017M621106)
论文发表日期：2023-02-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：17( 206-222 )
英文信息