桃花花型(铃形/蔷薇形)基因型鉴定、分子标记开发与利用
吉爽秋1
王力荣2
李勇2
朱更瑞2
曹珂2
方伟超2
陈昌文2
王新卫2
张琦1
吴金龙2
1.塔里木大学园艺与林学院,新疆阿拉尔 8433002.中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009
摘要：[目的]进一步完善桃花型基因型分类,开发桃花型相关分子标记,为观赏桃花的分子辅助育种提供理论支持.[方法]利用全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)、IGV可视化软件分析,以及竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术,在定位到的候选位点进行鉴定分析.[结果]GWAS定位分析在Pp08:14518604～14521291 bp存在一个ms179810转座子的缺失,x2验证结果表明,转座子的插入与缺失与花型性状无显著性关系.在转座子上游33980 bp处鉴定到一个单碱基核苷酸(SNP)变异,变异类型分为CC型、AC型、AA型3种,比对结果显示基因型为CC型、AC型,其表型为铃形,基因型为AA型,其表型为蔷薇形,在145份桃自然群体中鉴定准确率为98.62％.但是通过表型比对发现,基因型为CC时,铃形花冠直径为(1.54±0.46)cm,同时,基因型杂合的中蟠17号自交群体后代192株中基因型与表型准确率在98.44％.[结论]根据桃基因组中Pp08:14484624 bp处的变异类型以及桃花型的调查结果,首次将铃形花基因型细分为纯合铃形和杂合铃形,且开发了同时鉴定纯合铃形、杂合铃形及蔷薇形的分子标记.
关键词：桃花型全基因组关联分析(GWAS)IGV竞争性等位基因特异性PCR(KASP)
分类号：S662.1(果树园艺)
资助基金：新疆维吾尔自治区研究生科研创新项目(XJ2022G246)中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-ZZFR-01)
论文发表日期：2023-03-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 422-431 )
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